Testy amplifikacji kwasów nukleinowych, znane również jako NAT lub NAAT, są używane do identyfikacji małych ilości DNA lub RNA w testowanych próbkach. Jeśli chodzi o testowanie STD , dostępne są NATy, które mogą wykrywać wiele różnych chorób przenoszonych drogą płciową. W rzeczywistości większość testów moczu na choroby przenoszone drogą płciową przeprowadza się przy użyciu testów amplifikacji kwasów nukleinowych.
Jak działają testy amplifikacji kwasów nukleinowych?
Istnieje kilka różnych rodzajów testów amplifikacji kwasów nukleinowych, ale wszystkie opierają się na tej samej zasadzie.
NAT wykorzystuje serię powtarzających się reakcji chemicznych, aby utworzyć liczne kopie DNA lub RNA, które lekarze próbują wykryć. Reakcje te wzmacniają sygnał kwasów nukleinowych w badanej próbce, dzięki czemu są łatwiejsze do zidentyfikowania. O wiele łatwiej jest znaleźć 10 000 kopii genu niż 10.
Co to ma wspólnego z testowaniem STD?
Proces amplifikacji bakteryjnych lub wirusowych kwasów nukleinowych sam w sobie nie jest testem STD . Zamiast tego, gdy ilość DNA lub RNA została zwiększona w próbce za pomocą PCR lub LCR , do wykrycia tego wykorzystuje się więcej konwencjonalnych testów. Testy te zwykle obejmują pewną formę hybrydyzacji kwasów nukleinowych. W tych testach próbka jest sondowana sztucznie wytworzoną komplementarną nicią DNA lub RNA, która została w jakiś sposób oznaczona, co ułatwia jej wykrycie. Może pomóc wyobrazić sobie to jako blask w ciemnym tagu, który przylega tylko do jednej bardzo konkretnej informacji identyfikującej.
Testy amplifikacji kwasów nukleinowych są niezwykle użyteczne w testach STD. Pozwalają lekarzom na wykrycie patogenu STD, nawet jeśli występuje tylko bardzo mała liczba organizmów. Jest to technologia, która umożliwiła badanie moczu na choroby przenoszone drogą płciową , które wcześniej były wykrywalne tylko przez wymaz.
Ponadto, ponieważ testy amplifikacji kwasów nukleinowych są niezwykle czułe na nawet niewielkie ilości wirusowego DNA, są one bardzo ważne dla badania podaży krwi. Testy te umożliwiają wykrycie niewielkich ilości HIV i innych patogenów przenoszonych przez krew, które w innym przypadku mogłyby zostać przeoczone.
Dostępne są również niezamplifikowane testy kwasów nukleinowych dla niektórych chorób przenoszonych drogą płciową, takich jak rzeżączka i chlamydia . Niesdrożone testy hybrydyzacji kwasów nukleinowych są bardziej prawdopodobne, gdy oczekuje się, że będą obecne duże ilości bakteryjnego lub wirusowego DNA (lub RNA), na przykład w wymazie z cewki moczowej lub w próbce kultury bakteryjnej . W takich okolicznościach wzmocnienie nie jest konieczne. W tych próbkach, jeśli obecne jest DNA lub RNA, powinno być obecne w wykrywalnych ilościach.
Przykład tego testu w działaniu
Testy amplifikacji kwasów nukleinowych są niezwykle czułymi metodami wykrywania obecności bakterii lub wirusów w próbce biologicznej. Jeśli chodzi o wykrywanie opryszczki narządów płciowych w bólu od osoby, która ma objawy, testy te służą jako realna alternatywa dla kultury wirusowej . Kultury wirusowe mogą być trudne do wykonania dla niektórych laboratoriów. W przeciwieństwie do testów krwi opryszczki , NAT nadal wymaga bezpośredniego określenia, czy wirus jest obecny w próbce, a nie szuka przeciwciał anty-herpes.
Wzmacnianie kwasu nukleinowego pozwoliło również na rozprzestrzenianie się przesiewowego wykrycia chlamydii i rzeżączki w całym kraju. Teraz takie badania przesiewowe można teraz wykonywać na próbkach moczu zamiast wymazu z cewki moczowej lub szyjkowo-pochwowej. W związku z tym łatwo jest przetestować dużą liczbę młodych mężczyzn i kobiet na choroby przenoszone drogą płciową w różnych warunkach klinicznych i nieklinicznych. Zbieranie moczu nie wymaga specjalistycznej wiedzy medycznej, a ludzie chętniej spożywają kawę w kubku niż pobierają wymaz z narządów płciowych.
Naukowcy wykorzystali również testy amplifikacji kwasów nukleinowych, aby uzyskać więcej informacji na temat zakresu problemu bezobjawowych chorób przenoszonych drogą płciową w Stanach Zjednoczonych.
Programy przesiewowe na dużą skalę oparte na NAT zostały wdrożone w wojsku, w miejskich nastolatkach, w mężczyznach uprawiających seks z mężczyznami oraz w innych grupach wysokiego ryzyka i niskiego ryzyka. Testy te pozwalają na wykrywanie chorób przenoszonych drogą płciową w małych próbkach, które często są brane jako część dużych badań nad zdrowiem populacji.
> Źródła:
> Bernstein KT, Chow JM, Pathela P, Prezent TL. Przesiewowe badanie przesiewowe chorób przenoszonych drogą płciową poza kliniką - implikacje dla współczesnego programu chorób przenoszonych drogą płciową. Sex Transm Dis. 2016 Feb; 43 (2 Suppl 1): S42-52. doi: 10.1097 / OLQ.0000000000000343.
> Chow EPF, Walker S, Czytaj TRH, Chen MY, Bradshaw CS, Fairley CK. Zgłoszone przez siebie użycie płukania jamy ustnej i gardłowego wykrywania detekcji poprzez test amplifikacji kwasu nukleinowego. Sex Transm Dis. 2017 Październik; 44 (10): 593-595. doi: 10.1097 / OLQ.0000000000000654.
> Trembizki E, Costa AM, Tabrizi SN, Whiley DM, Twin J. Możliwości i pułapki molekularnych testów do wykrywania patogenów przenoszonych drogą płciową. Patologia. 2015 kwietnia, 47 (3): 219-26. doi: 10.1097 / PAT.0000000000000239.